Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1978683	1978697	15	33 [0]	[0] 29	motA	proton conductor component of flagella motor

TGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAG  >  W3110S.gb/1978635‑1978682                                                | tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1820034/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:97534/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:881090/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:67263/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:520260/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:463466/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:2408450/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:2345795/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:2344580/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:2286302/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:2268206/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:2253949/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1939816/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1920531/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1905717/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1895742/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:176555/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1739149/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1707631/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1640596/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1638967/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1632373/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1604182/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1490581/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1460822/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1392177/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1367230/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1349301/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCACCGCCTTCAg  <  1:1286151/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTGGAGCCACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1531741/48‑1 (MQ=255) tGCTTTGGTGTATTTCGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:584423/48‑1 (MQ=255)  gCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:1055637/47‑1 (MQ=255)  gCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAg  <  1:117301/47‑1 (MQ=255)                                                | TGCTTTGGTGTATTTGGAGCGACGAAACAGCAACGGCAGCGCCTTCAG  >  W3110S.gb/1978635‑1978682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑