Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2002577	2002648	72	14 [0]	[1] 21	[fliZ]	[fliZ]

CTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTAAA  >  W3110S.gb/2002513‑2002576                                                                | ctgaTTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:2042077/4‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1108662/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1123949/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1325922/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:139758/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1607070/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1607909/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1681669/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:1821564/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:2190054/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:258198/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:416108/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:489059/1‑64 (MQ=255) cTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTaaa  >  1:528108/1‑64 (MQ=255)                                                                | CTAATTTCATATTCACCCCGAATGTTGTTATGTCTGTTTGCAGTGTAGAGCCATTGTTTGTAAA  >  W3110S.gb/2002513‑2002576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑