Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2008027 2008172 146 24 [0] [0] 7 fliT predicted chaperone

TGAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACG  >  W3110S.gb/2007971‑2008026
                                                       |
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tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:671746/56‑1 (MQ=255)
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tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:378515/56‑1 (MQ=255)
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tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:2225381/56‑1 (MQ=255)
tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:1287686/56‑1 (MQ=255)
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tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:1880773/56‑1 (MQ=255)
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tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:1616998/56‑1 (MQ=255)
tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:1570437/56‑1 (MQ=255)
tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:1569374/56‑1 (MQ=255)
tgAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:1363690/56‑1 (MQ=255)
       ggTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACg  <  1:2013118/49‑1 (MQ=255)
                                                       |
TGAATGCGGTGCAGGAGATTGCACATTTGACTGAAGAGGTTGACCCGTCCACCACG  >  W3110S.gb/2007971‑2008026

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: