Missing coverage evidence...
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CAGAACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGAAAGCAGAACACCAA  >  W3110S.gb/2111904‑2111980                                                                 |             cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2216714/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:970509/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:955970/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:930922/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:81672/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:729163/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:668269/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:644687/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:493194/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:471564/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2529794/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2434898/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2286269/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2283379/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2242002/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:2203298/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1559827/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1212015/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1265579/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1294633/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1389987/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1473120/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1510542/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1939471/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1618/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1666585/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1759004/65‑1 (MQ=255) cagaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1812181/65‑1 (MQ=255)  agaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:482854/64‑1 (MQ=255)  agaACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1654083/64‑1 (MQ=255)             gCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGAAAGCAGAACACCaa  <  1:1524292/65‑1 (MQ=255)             gCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGAAAGCAGAACACCaa  <  1:1848586/65‑1 (MQ=255)                  gAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:1029740/48‑1 (MQ=255)                        aCCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGaaa              <  1:958280/42‑1 (MQ=255)                                                                 |             CAGAACCAAAAAGCCATGAGCAAACCCTTTTGGTATCCACAACTGCTGCTTATTATCAGCTGAAAGCAGAACACCAA  >  W3110S.gb/2111904‑2111980

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑