Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	117389	117405	17	21 [0]	[1] 21	ppdD	predicted major pilin subunit

CGGTAAGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAA  >  W3110S.gb/117401‑117470      |                                                                 cggtaAGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAg        <  1:2059580/64‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:2075110/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:835681/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:817741/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:731936/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:681732/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:504254/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:383275/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:2486648/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:2319974/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:216387/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:2146925/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1034890/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1840690/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:172077/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1651244/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1494181/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1423947/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1303157/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1058996/65‑1 (MQ=255)      aGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGaa  <  1:1038762/65‑1 (MQ=255)      |                                                                 CGGTAAGGCACAAAGGTTTGTAGCATGTCGGTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAA  >  W3110S.gb/117401‑117470

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑