Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2146173	2146206	34	24 [0]	[0] 40	yegE	predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein

CCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTT  >  W3110S.gb/2146207‑2146271 |                                                                 ccGTGGCTACGGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCt   >  1:1942147/1‑64 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGa                     >  1:2281594/1‑46 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2220246/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2200015/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2332430/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2334293/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2456630/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2509173/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2537195/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:265549/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:277879/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:350759/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:596250/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:629372/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:813136/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:902900/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:925906/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:928862/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:959781/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:976722/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:997913/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1950654/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1070455/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1114133/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:128604/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1394191/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1478676/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:152489/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1754403/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1777615/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1957111/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:1978601/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:205161/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2067341/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:207066/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2100776/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:212219/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCtt  >  1:2133439/1‑65 (MQ=255) ccGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCt   >  1:1034795/1‑64 (MQ=255) ccGTGCCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCAGCCAACATCATGAc                    >  1:1583859/1‑47 (MQ=38) |                                                                 CCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTT  >  W3110S.gb/2146207‑2146271

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑