Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2207516	2207519	4	12 [0]	[0] 44	yehK	hypothetical protein

ATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAT  >  W3110S.gb/2207520‑2207584 |                                                                 aTGAGTGTATTGATGAGCTGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:492290/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:59913/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2325191/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2435485/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2454527/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2489974/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:334349/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:483450/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:515570/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:586983/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:593731/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2262498/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:603520/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:640207/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:665728/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:742340/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:791000/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:90731/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:913681/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:935846/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:961287/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:987101/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:166717/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1023969/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1052648/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1217727/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1238305/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1284876/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1422834/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1428483/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1451279/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1490281/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1605685/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1006526/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1675368/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1679227/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:1770077/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2044847/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2092873/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  >  1:2125549/1‑65 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2199885/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2200740/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:2218389/65‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCAGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAt  <  1:170103/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAAT  >  W3110S.gb/2207520‑2207584

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑