Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2316533	2316568	36	9 [0]	[0] 32	ompC/rcsD	outer membrane porin protein C/phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

TTAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAATTAT  >  W3110S.gb/2316569‑2316633 |                                                                 ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:2029565/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:958771/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:916168/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:868642/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:795597/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:780684/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:743560/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:698410/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:595014/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:562676/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:479261/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:2388465/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:2280592/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:2165266/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:2060257/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1005531/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1901334/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1897893/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1858094/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1853990/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1838222/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1817673/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1765295/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1615233/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1380507/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1372459/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1215135/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1116969/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1107930/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1047676/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAattat  >  1:1030955/1‑65 (MQ=255) ttAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAatta   >  1:2448915/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TTAACTATTTCACAAATAATTAACATCCGCATAATTTCCAGCAATCTTTGTTTATTTGCAATTAT  >  W3110S.gb/2316569‑2316633

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑