Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2332299	2332319	21	22 [0]	[0] 44	yfaP	conserved hypothetical protein

CCATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGCC  >  W3110S.gb/2332320‑2332383 |                                                                ccATCGGGCGTAACAAGGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2008234/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCTGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1167440/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTAtt                            >  1:2453378/1‑38 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATc                   >  1:780746/1‑47 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:597401/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2296107/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2309696/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2441531/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2449251/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2534221/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2543849/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:325252/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:35762/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:53997/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2173880/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:647179/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:661199/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:707418/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:778405/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:791417/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:840763/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:892686/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:943429/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1694303/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1063881/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1218860/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1290940/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1480691/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:152433/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:160941/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1611697/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1691108/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1052800/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1753318/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1770582/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1775635/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1808883/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1851283/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2060983/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:2099081/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:211636/1‑64 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGc   >  1:1904425/1‑63 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGc   >  1:837998/1‑63 (MQ=255) ccATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCAGTATCCCACGAGAGAACCAGcc  >  1:1201694/1‑64 (MQ=255) |                                                                CCATCGGGCGTAACAACGTGAAGGTCGAGGTCGGTATTGTCCGTATCCCACGAGAGAACCAGCC  >  W3110S.gb/2332320‑2332383

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑