Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2409499	2409664	166	20 [0]	[0] 31	nuoA	NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A

CAGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATG  >  W3110S.gb/2409665‑2409729 |                                                                 caGGCCAATGGCTACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1653440/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1855651/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:937588/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:892218/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:872416/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:712387/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:701760/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:540058/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:501957/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:444934/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:426793/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:249941/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:2476612/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:2293773/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:2117660/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:2011514/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1902660/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1219194/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1816458/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1812853/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1662620/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1623385/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1601345/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1594317/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1592603/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1587643/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1444936/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1367361/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1298197/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1263411/65‑1 (MQ=255) caGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATg  <  1:1263294/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CAGGCCAATGGCAACGATAAGAAAGATAGCGAATGCCCAGTGATGAGCGATGACTTCAGTGGATG  >  W3110S.gb/2409665‑2409729

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑