Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2443639	2443746	108	17 [1]	[0] 25	flk	predicted flagella assembly protein

GATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAC  >  W3110S.gb/2443747‑2443811 |                                                                 gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2291131/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:968206/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:884213/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:865156/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:837844/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:814224/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:735417/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:677178/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:495447/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2538911/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2515203/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2490607/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2418348/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1144278/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2218132/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2147089/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:2101366/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1987814/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1955479/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:189405/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1893446/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1778453/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1389135/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1362936/65‑1 (MQ=255) gATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAc  <  1:1261459/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GATTATATCCGTCATAACTTTGGTCAGACGCCGCTGAATCAGCTCTCACCGGAGCAATTAAAAAC  >  W3110S.gb/2443747‑2443811

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑