Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2477959	2478064	106	27 [0]	[0] 29	yfdN	hypothetical protein

CCGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGCTCT  >  W3110S.gb/2478065‑2478129 |                                                                 ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTgg                    >  1:136861/1‑47 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1834845/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:909918/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:856150/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:517909/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:438908/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:293457/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:2395050/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:2272004/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:2100272/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:2045795/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:2020464/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1995801/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1937621/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1040390/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1820608/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1816174/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:175515/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1744556/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1722707/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1589189/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1531846/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1418793/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1336007/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1189553/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1113553/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:1097186/1‑65 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctc   >  1:2156234/1‑64 (MQ=255) ccGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTCGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGctct  >  1:329354/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CCGACATAGAAATTGCGCACAGGTCTGGTTTCACGAACTGGTTGTGGTTCCGGATCCTGCGCTCT  >  W3110S.gb/2478065‑2478129

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑