Missing coverage evidence...
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CTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATA  >  W3110S.gb/170336‑170399 |                                                                cTGTCGCTGGTGCTCCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:809456/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:492530/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2270550/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2312620/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2318040/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2379834/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2468384/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:276758/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:37855/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:437299/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:446329/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:464920/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2163423/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:535149/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:546208/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:679768/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:686889/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:692506/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:713155/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:850542/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:907921/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1659873/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1154114/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1206012/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1278319/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1302135/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1307341/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1324835/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1461255/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1518124/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1522604/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1142176/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1683548/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:173952/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1743820/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1829144/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1896462/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1912518/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1933448/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:1934683/64‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGata  <  1:2013345/64‑1 (MQ=255) |                                                                CTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGATA  >  W3110S.gb/170336‑170399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑