Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2679344	2679355	12	6 [0]	[0] 18	yphG	conserved hypothetical protein

CAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCT  >  W3110S.gb/2679356‑2679420 |                                                                 cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:2325117/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:948567/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:882923/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:536420/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:535930/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:497310/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:450523/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:37267/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:308179/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1039078/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:2293059/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:2193427/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1798846/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1721250/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1629238/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1500429/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1468682/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCt  <  1:1102791/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CAGGGTGGGCATTCCCCAGTTAATCAGTTGCCCGGCGGTCATCAGGGCGTTAACGTCGCGTCCCT  >  W3110S.gb/2679356‑2679420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑