Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2679474	2679519	46	14 [0]	[0] 21	yphG	conserved hypothetical protein

TCTCGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCAA  >  W3110S.gb/2679520‑2679584 |                                                                 tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAAGACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:2114746/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:93649/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:100755/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:91717/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:905496/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:819577/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:800898/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:328814/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:292446/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:2540688/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:2399652/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:2233812/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1987001/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1925948/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:192092/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1909433/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1832468/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1712675/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1636467/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:1574610/65‑1 (MQ=255) tctcGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCaa  <  1:101255/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TCTCGCGCTGCACACGCGCGTTGTCCTGACGACCACTTAACACCAGCAGCAGATTATGCAGGCAA  >  W3110S.gb/2679520‑2679584

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑