Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2736763	2736772	10	29 [0]	[0] 59	pheA	fused chorismate mutase P and prephenate dehydratase

GCCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAGG  >  W3110S.gb/2736773‑2736836 |                                                                gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTa        >  1:2498650/1‑58 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATc     >  1:482461/1‑61 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:346177/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2185487/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2223397/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2240845/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2259144/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2332096/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2345479/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2351769/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2461284/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:24680/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2500579/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2503451/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2516861/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:330144/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2174402/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:385171/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:405078/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:518567/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:536507/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:703203/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:731882/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:759057/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:784362/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:864936/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:885422/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:94632/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:982899/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:996531/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1543697/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1047765/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1048532/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1049694/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1127995/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1137364/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1156234/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1211004/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1216780/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1237978/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:12534/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1255321/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1312286/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1315289/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1535752/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1003748/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1566440/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1579474/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1580545/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1773317/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1795707/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1841834/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1870433/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:1871794/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2015768/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2056752/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:2137758/1‑64 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAg   >  1:1683138/1‑63 (MQ=255) gcCCGTCACTCTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAgg  >  1:189660/1‑64 (MQ=255) |                                                                GCCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCAGG  >  W3110S.gb/2736773‑2736836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑