Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2750777	2750789	13	9 [0]	[0] 40	recN	recombination and repair protein

CTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATT  >  W3110S.gb/2750790‑2750854 |                                                                 ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGAt                          >  1:2227685/1‑41 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCa                       >  1:1705187/1‑44 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCAc             >  1:2101467/1‑54 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:54800/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:259829/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:277055/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:339518/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:378987/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:388591/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:458801/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:474399/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:479395/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2457176/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:549616/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:73385/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:758796/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:760769/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:76306/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:799837/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:839458/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:955455/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1973320/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1217132/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1234379/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:129091/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1592845/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1614850/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1695159/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1790221/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2518559/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2093287/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2128175/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2225932/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2230241/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:2413689/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1076310/1‑65 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAt   >  1:2354437/1‑64 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAAt   >  1:294392/1‑64 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGATCATCAAt   >  1:1922940/1‑64 (MQ=255) ctGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGACAGCACGCTCATCAAtt  >  1:1865802/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CTGTCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATT  >  W3110S.gb/2750790‑2750854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑