Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2769541	2769575	35	16 [0]	[0] 31	yfjS	hypothetical protein

GGGTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATGCGC  >  W3110S.gb/2769576‑2769640 |                                                                 gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCGGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:498695/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:219486/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:942846/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:927376/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:922145/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:918054/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:840832/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:744964/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:703173/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:615891/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:544585/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:474231/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:366262/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:301270/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:2489060/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:2224804/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1007240/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:2094911/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:2052060/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1958132/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:19253/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1898338/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1896942/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1661680/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1562544/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1539584/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1466156/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1322242/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1087224/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:105773/65‑1 (MQ=255) gggTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATgcgc  <  1:1024548/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GGGTGGCAGTTACTACTATCTGGTAGATATGGAGGAGAAAACCGTCCAGCCGCTGATGAATGCGC  >  W3110S.gb/2769576‑2769640

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑