Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2776854	2776867	14	15 [0]	[0] 11	ypjA	adhesin‑like autotransporter

CCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCT  >  W3110S.gb/2776868‑2776910 |                                           ccccaccccaAGATTCCCGCTTAACTTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:2150256/43‑1 (MQ=18) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:1164648/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:1195939/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:1249374/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:1461628/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:1941379/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:2023405/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:2103129/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:2541408/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:263857/43‑1 (MQ=255) ccccaccccaAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCt  <  1:311515/43‑1 (MQ=255) |                                           CCCCACCCCAAGATGCCCGCTTAACGTACTGCTGAATGAGGCT  >  W3110S.gb/2776868‑2776910

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑