Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2778762	2778777	16	25 [0]	[0] 10	ypjA	adhesin‑like autotransporter

GGACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGT  >  W3110S.gb/2778778‑2778841 |                                                                ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:1173687/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:132081/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:1471941/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:1528486/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:1845887/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:1992391/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:348557/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:680372/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:75417/64‑1 (MQ=255) ggACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGt  <  1:809603/64‑1 (MQ=255) |                                                                GGACGATATCTGTCGCTTTGCCATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGT  >  W3110S.gb/2778778‑2778841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑