Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2865553	2865571	19	19 [0]	[0] 21	rpoS	RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor

CATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAT  >  W3110S.gb/2865572‑2865636 |                                                                 cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCa   >  1:899605/1‑64 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCa   >  1:152591/1‑64 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCa   >  1:2450943/1‑64 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1983778/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:720637/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:42415/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:2494962/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:2494274/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:2474608/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:2454483/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:2435276/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:2317850/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1011761/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1760899/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1677419/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1428236/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1312097/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1258994/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1231724/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt  >  1:1108604/1‑65 (MQ=255) cATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTAGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGtt     >  1:1642489/1‑62 (MQ=255) |                                                                 CATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAT  >  W3110S.gb/2865572‑2865636

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑