Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2943883	2944014	132	25 [0]	[0] 34	ygdL	conserved hypothetical protein

TCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATA  >  W3110S.gb/2944015‑2944078 |                                                                tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGAc      >  1:1406618/1‑60 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:1037890/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:866766/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:734331/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:513747/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:449525/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:398100/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2498320/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2429536/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2329543/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2292836/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2273421/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2250259/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:216345/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2057488/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:101354/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:1224492/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:1330312/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:1348300/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:1537484/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAAt   <  1:2018267/63‑1 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:2345064/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:1557301/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:1386292/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:26884/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:1694736/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:1704200/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:510828/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:62078/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:71174/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:1145887/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:2163107/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:88498/1‑64 (MQ=255) tCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATa  >  1:930327/1‑64 (MQ=255) |                                                                TCGGATCAATCTGCCCACCCGCGCCACCGGTTGTGACCAGTGGGATTTTATTGCGCCGACAATA  >  W3110S.gb/2944015‑2944078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑