Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2967834	2967864	31	10 [0]	[0] 40	nudH/mutH	nucleotide hydrolase/methyl‑directed mismatch repair protein

AAGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAT  >  W3110S.gb/2967865‑2967929 |                                                                 aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:489444/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2446609/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2452191/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2540303/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:271923/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:399133/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:413286/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:414885/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:416208/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:478656/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:232941/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:578407/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:70064/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:712340/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:767083/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:866611/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:901378/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:978856/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:998728/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:999812/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1742657/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:111155/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1132922/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1171359/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1434803/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1451801/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1581067/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1646283/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1653456/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1682523/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1041941/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1772733/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1796268/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1896828/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1911686/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:1975002/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2009689/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2015719/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2036886/65‑1 (MQ=255) aaGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAt  <  1:2225657/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AAGCCCGATATAGACATTTTAAAATATTCATTATCAGTCAATGCATTACATGTAATTTTAGTAAT  >  W3110S.gb/2967865‑2967929

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑