Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	200926	200964	39	7 [0]	[0] 38	hlpA	periplasmic chaperone

TAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGA  >  W3110S.gb/200965‑201029 |                                                                 tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTacac       >  1:289724/1‑60 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:436944/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2213115/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2220011/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2279729/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2375409/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2422609/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2542698/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:266623/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:399726/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2186653/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:449125/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:496389/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:714074/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:740586/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:767108/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:821448/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:831728/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:860751/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1898493/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1128266/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1275878/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1303491/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1676193/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1682839/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1803496/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:183615/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1857131/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1863924/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:101223/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:190402/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1910290/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1943551/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:1995523/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2071064/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2096145/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2128023/1‑65 (MQ=255) tAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGa  >  1:2158277/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TAAGTAATGCCTTCAATTCGACTGGCTGATTTAGCGCAGCAGTTGGATGCAGAACTACACGGTGA  >  W3110S.gb/200965‑201029

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑