Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3066637	3066704	68	25 [0]	[0] 22	yggE	conserved hypothetical protein

AATGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCAAA  >  W3110S.gb/3066705‑3066769 |                                                                 aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:2243359/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:965292/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:870730/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:830889/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:765529/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:680371/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:60529/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:345734/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:264872/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:2462440/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:2270815/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:145728/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:2148908/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:2053265/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1928210/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1845603/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1774290/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1772757/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1747312/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:172278/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1706798/65‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCaaa  <  1:1526815/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATGCCGCCAGGGCGATAACTTTGAACTTCACGTTAGTCTCTCCGTGTTAATTGACTTGCCCAAA  >  W3110S.gb/3066705‑3066769

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑