Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3097225	3097242	18	11 [0]	[2] 22	yggM	conserved hypothetical protein

CGCAGTTGTTCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATCG  >  W3110S.gb/3097236‑3097305        |                                                               cgcAGTTGTTCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTtcatc         >  1:104504/1‑63 (MQ=255) cgcAGTTGTTCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCaa       >  1:1102027/1‑65 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:837678/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1014754/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:624567/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:598568/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:416728/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:261998/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:25739/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:2440420/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:2344236/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:2254983/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:2212233/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:2138706/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:2085934/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1928751/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1882919/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1652586/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1468291/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1321097/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1241726/63‑1 (MQ=255)        gttCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATcg  <  1:1086369/63‑1 (MQ=255)        |                                                               CGCAGTTGTTCGGTATCTTTTTTCCAGCGTTCATTAGCTTGGTTGATATCGTCAATTTTCATCAAAATCG  >  W3110S.gb/3097236‑3097305

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑