Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3113594	3113635	42	23 [3]	[0] 22	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

TCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGGTTGTT  >  W3110S.gb/3113636‑3113700 |                                                                 tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:235907/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:893034/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:839834/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:802734/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:617073/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:537156/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:473639/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:463902/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:27469/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:2491303/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:2417293/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:135080/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:2260990/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:2181861/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1947439/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1942265/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1909021/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1646269/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1611323/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1548559/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1546624/65‑1 (MQ=255) tCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGgttgtt  <  1:1397378/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TCCTTCAGCTGTGCGTACATCAGCAGACGGTCACCCGCACCGCCGCGTGCCCATGCCTGGTTGTT  >  W3110S.gb/3113636‑3113700

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑