Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3213452	3213484	33	29 [0]	[0] 21	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

CTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGT  >  W3110S.gb/3213485‑3213549 |                                                                 cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGAtt         >  1:403424/1‑58 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCgg   >  1:2070973/1‑64 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:2405076/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:905257/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:836922/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:703193/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:533300/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:307112/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:2518036/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:251216/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:2412481/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:1300806/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:2399229/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:2190515/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:2161796/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:182472/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:1705854/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:1675122/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:1483662/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGt  >  1:1385372/1‑65 (MQ=255) cTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAACCGGt  >  1:702232/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CTGCGCAAACTGCGTCACCCGAGCCGTTCTGAAGTGCTGCGTAGCTTCCTGGACGATTAATCGGT  >  W3110S.gb/3213485‑3213549

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑