Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3216623	3216657	35	4 [0]	[0] 14	aer	fused signal transducer for aerotaxis sensory component and methyl accepting chemotaxis component

TAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATC  >  W3110S.gb/3216658‑3216722 |                                                                 tAATCAGCGTAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTAATGTCGGCGATATCGTCCATTGTCtt      >  1:1090255/1‑61 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:1105508/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:1196050/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:1333333/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:1598530/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:1762831/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:2165578/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:2166778/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:2249441/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:534009/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:65140/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:706430/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:750064/1‑65 (MQ=255) tAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATc  >  1:912901/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATC  >  W3110S.gb/3216658‑3216722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑