Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	231324	231324	1	15 [0]	[0] 25	yafD	conserved hypothetical protein

AGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCG  >  W3110S.gb/231325‑231389 |                                                                 aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:27372/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:998840/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:890608/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:811353/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:769043/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:690058/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:682281/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:638981/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:560864/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:464859/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:377987/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:335090/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:330806/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:1126032/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:2534542/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:2527792/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:2281183/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:2139348/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:2082165/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:2004248/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:1837501/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:1751305/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:1546530/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:1514096/65‑1 (MQ=255) aGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCg  <  1:1127232/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGATGCACATCTGGTGTTATTGCAGGAAGCGCAGACAACGCCAGAGTTAGTACAGTTTGCGACCG  >  W3110S.gb/231325‑231389

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑