Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3496285	3496286	2	5 [0]	[0] 38	ptsA	fused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component

TGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAGG  >  W3110S.gb/3496287‑3496351 |                                                                 tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAGAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:405895/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:392558/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2192819/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2341346/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2361588/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2429131/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2468583/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2503235/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2524705/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:26794/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:386439/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2185098/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:617179/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:623185/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:640852/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:721238/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:721899/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:726432/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:973961/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2184414/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1127342/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1136536/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1137506/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1388560/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1481107/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1526094/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1585349/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1808618/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1828308/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:186392/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1910060/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1922023/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1943599/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2103586/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:2142212/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:214486/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAgg  >  1:1052310/1‑65 (MQ=255) tGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAg   >  1:1862582/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TGGATTGGTCTGTGCGGTGAGCTGGGAGCGAAAGGTTCCGTGCTGCCGTTGCTGGTCGGCTTAGG  >  W3110S.gb/3496287‑3496351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑