Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3499025	3499068	44	31 [0]	[0] 12	yijF	conserved hypothetical protein

AGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAACC  >  W3110S.gb/3499069‑3499132 |                                                                aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGGCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:307511/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACGAAcc  <  1:1660961/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:1102538/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:1394029/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:1589764/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:1966026/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:2259257/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:237666/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:556372/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:605124/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:713759/64‑1 (MQ=255) aGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAAcc  <  1:772153/64‑1 (MQ=255) |                                                                AGCCACTCCTTAAAATCTCCCGCCGTTCCACCAACCGTGGTACAAATCCAGGCCAATACCAACC  >  W3110S.gb/3499069‑3499132

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑