Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3501270	3501355	86	4 [0]	[0] 26	katG	catalase/hydroperoxidase HPI(I)

CTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGT  >  W3110S.gb/3501356‑3501418 |                                                               cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGt                      >  1:1483386/1‑43 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTc                 >  1:1920701/1‑48 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGccacca          >  1:2260994/1‑55 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGccac            >  1:378348/1‑53 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGcc              >  1:1921632/1‑51 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAgg   >  1:745655/1‑62 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAgg   >  1:476558/1‑62 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:992569/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:105659/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:977318/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:881009/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:550419/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:413214/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:38887/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:316572/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:313750/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:282683/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:2189549/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:1988101/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:186994/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:1743241/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:1583301/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:1368109/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:1155926/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGt  >  1:1081723/1‑63 (MQ=255) cTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGACACCACGGAAGGt  >  1:2180028/1‑63 (MQ=255) |                                                               CTGCGGCATTAATGCCAGACGCGCACCGTTGGCACCACCGCGTTTGTCGCCACCACGGAAGGT  >  W3110S.gb/3501356‑3501418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑