Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3501451	3501464	14	10 [0]	[0] 36	katG	catalase/hydroperoxidase HPI(I)

CCAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTG  >  W3110S.gb/3501465‑3501529 |                                                                 ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCtcg                      >  1:28728/1‑45 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGCTCGGCTg  >  1:1800526/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCt   >  1:2241086/1‑64 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2521265/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2078516/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2152693/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2272300/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2364432/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2412931/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2440292/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2071863/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:366013/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:498775/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:593352/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:652126/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:692997/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:869517/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:917036/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1491319/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1105769/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:111392/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1155209/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1225438/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1344678/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1354154/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1359047/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1065910/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1509158/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1569221/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1603467/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1813769/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1859972/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1881448/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:1932260/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTg  >  1:2007366/1‑65 (MQ=255) ccAGAATCCGCAATAGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCt   >  1:392624/1‑64 (MQ=255) |                                                                 CCAGAATCCGCAATCGCGAATTTCAGATCGATAATGTCCTGCTCGGTCGGGTTGTAGATCGGCTG  >  W3110S.gb/3501465‑3501529

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑