Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3538473 3538560 88 41 [2] [0] 37 rhaS DNA‑binding transcriptional activator, L‑rhamnose‑binding

CAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCA  >  W3110S.gb/3538561‑3538625
|                                                                
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGGTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:666955/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTATCGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:2299751/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAAcgcg                        >  1:311159/1‑43 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAAcgc                         >  1:165104/1‑42 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGcc  >  1:1274785/1‑63 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGccaa  >  1:1684556/1‑63 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:443730/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:2250722/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:2298802/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:2307653/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:266288/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:305880/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1986753/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:517691/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:547463/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:665376/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:687733/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:726827/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:795954/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:949902/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1640155/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1060811/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1152239/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1167866/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1191711/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1241947/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1255894/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1277789/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1432099/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:2160881/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1726186/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1774938/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:186436/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:191176/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1941894/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:1054292/1‑65 (MQ=255)
cAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCa  >  1:2151697/1‑65 (MQ=255)
|                                                                
CAACCAGCTGTCGCACCTGCTGCAATACGCTGTGGTTAACGCGCCAGTGAGACGGATACTGCCCA  >  W3110S.gb/3538561‑3538625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: