Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3580587	3580641	55	10 [1]	[0] 8	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

GACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCT  >  W3110S.gb/3580642‑3580706 |                                                                 gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:1034444/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:1195300/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:1493607/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:55114/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:561537/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:717913/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:71911/65‑1 (MQ=255) gACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCt  <  1:745276/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GACGGCATGATCCTGCTGGAGATGGCTCCGATGGATAACCAGCGCCGCTTAAGTCAGGAACAGCT  >  W3110S.gb/3580642‑3580706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑