Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3596043	3597915–3597315	1273–1873	12 [0]	[0] 24	rrfA–[rrlA]	rrfA,[rrlA]

CTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCC  >  W3110S.gb/3597916‑3597979 |                                                                cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2132967/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:688847/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:62061/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:339302/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:25155/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2393716/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2383359/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2249359/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2247980/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2239285/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2206749/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2141954/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:105373/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:21313/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:2073816/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1823204/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1801192/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1671501/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:122926/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1137073/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1135895/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1114656/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1094652/1‑64 (MQ=35) cTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTAACAGAACGCTCCCCTAccc  >  1:1890782/1‑64 (MQ=25) |                                                                CTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCC  >  W3110S.gb/3597916‑3597979

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑