Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3632560	3632638	79	7 [0]	[1] 15	rarD	predicted chloramphenical resistance permease

TCGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGA  >  W3110S.gb/3632638‑3632701  |                                                               tCGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:957947/64‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:113763/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:1209184/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:1352982/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:1699762/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:1809309/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:2054181/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:2204199/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:2219915/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:2479941/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:36422/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:487188/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:587599/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:982400/63‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGa  <  1:986402/63‑1 (MQ=255)  |                                                               TCGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGA  >  W3110S.gb/3632638‑3632701

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑