Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3815626	3815629	4	54 [0]	[0] 41	trmH	tRNA (Guanosine‑2'‑O‑)‑methyltransferase

CATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTACCC  >  W3110S.gb/3815630‑3815694 |                                                                 cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCa           >  1:1464033/1‑56 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:447463/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:2332422/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:2339685/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:2358656/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:2400650/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:2437388/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:332743/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:348556/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:446884/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:2064167/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:500851/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:547125/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:550165/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:655123/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:782661/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:798090/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:799610/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:933173/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:948171/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1605759/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1033949/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1036906/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1175390/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1197487/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1229178/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:125422/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1265620/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1335319/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1384068/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1421115/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1028769/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1671409/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1704476/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1723895/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1760762/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1810241/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1942695/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAccc  >  1:1998071/1‑65 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTAcca  >  1:2357566/1‑64 (MQ=255) cATGCCCTGGCCTTTGAGAAGAGCGACGGCATCGc                                >  1:2136414/1‑35 (MQ=255) |                                                                 CATGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGTACCC  >  W3110S.gb/3815630‑3815694

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑