Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3816775	3816853	79	8 [3]	[0] 31	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

AATCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGCTCT  >  W3110S.gb/3816854‑3816918 |                                                                 aaTCTCATCCGGGGAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctc   >  1:2221314/1‑64 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:2039123/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:990062/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:817483/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:804015/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:632766/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:592566/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:374343/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:371501/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:283432/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:2424779/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:2222041/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:215035/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:2051124/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:204044/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1069915/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1963377/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1892384/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1784510/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1769943/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1763018/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1698253/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1635992/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1542518/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1402617/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1345734/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1345589/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1302319/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:1297660/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:125822/1‑65 (MQ=255) aaTCTCATCAGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGctct  >  1:2336080/1‑65 (MQ=255) |                                                                 AATCTCATCCGGGAAGAGATCGGATTTAACGCTCTCGATAAATTCAAACGAACTACCGGCGCTCT  >  W3110S.gb/3816854‑3816918

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑