Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3861326	3861347	22	9 [0]	[0] 25	lldR	DNA‑binding transcriptional repressor

TGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGC  >  W3110S.gb/3861348‑3861412 |                                                                 tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:1680487/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:1716703/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:1717917/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:547589/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:418251/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:189674/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:376938/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:257190/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACg   >  1:2459328/1‑64 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:2323597/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:852206/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:851046/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:775697/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:739151/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:289639/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:2437572/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:2388207/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:108719/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1933577/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1797701/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1786382/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1334787/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1320797/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1303100/65‑1 (MQ=255) tGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGc  <  1:1290839/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TGGGTAAAACAATCATTAAGGAATCATCCACGTTAAGACATAAGCCTGAAGCGTGGTGATCACGC  >  W3110S.gb/3861348‑3861412

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑