Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3874811–3874965	3875089–3875068	104–279	11 [0]	[0] 7	rhsA	rhsA element core protein RshA

GATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCG  >  W3110S.gb/3875090‑3875154 |                                                                 gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:1018179/65‑1 (MQ=40) gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:1646128/65‑1 (MQ=40) gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:1667256/65‑1 (MQ=40) gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:1682740/65‑1 (MQ=40) gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:2288360/65‑1 (MQ=40) gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:455529/65‑1 (MQ=40) gATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCg  <  1:742299/65‑1 (MQ=40) |                                                                 GATAAATCGTCTGGATGCGGGTTCTGTCGTTCTGTATTGTGGTCAGCCGGTCGCCGTCCCAGCCG  >  W3110S.gb/3875090‑3875154

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑