Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3961303	3961318	16	16 [0]	[0] 22	yhjH	EAL domain containing protein involved in flagellar function

TGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGG  >  W3110S.gb/3961319‑3961383 |                                                                 tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTaa     >  1:765836/1‑62 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:209568/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:918351/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:777439/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:638508/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:520042/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:33326/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:327005/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:304322/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:2404691/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:2189018/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1303634/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1829759/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1818396/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1763235/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:169525/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1632068/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1543115/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1491209/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1373060/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACgg  >  1:1338793/1‑65 (MQ=255) tGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACga  >  1:1607937/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TGCTTACACCTGGCAGCCGATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGG  >  W3110S.gb/3961319‑3961383

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑