Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4040549	4040627	79	11 [0]	[0] 28	rpoH/livJ	RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor/leucine/isoleucine/valine transporter subunit

TATCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGC  >  W3110S.gb/4040628‑4040672 |                                             tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1996939/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:895431/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:838469/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:796251/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:781766/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:753125/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:687922/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:645679/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:582409/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:459286/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:32348/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:259523/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:2397117/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:2312922/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1137532/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1979860/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1977168/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:196476/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1951530/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1932667/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:19281/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1587825/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1523830/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:144422/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1332061/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1329086/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:1218051/1‑45 (MQ=255) tatCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGc  >  1:114778/1‑45 (MQ=255) |                                             TATCATAAAAATCGGGTATGTTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGC  >  W3110S.gb/4040628‑4040672

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑