Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	303861	303871	11	16 [0]	[0] 42	yagV	conserved hypothetical protein

CGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCT  >  W3110S.gb/303872‑303935 |                                                                cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTGGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2301720/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGttactta          >  1:1531991/1‑56 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTcc   >  1:1851526/1‑63 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:293323/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2067774/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2171562/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2244166/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2367872/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:242273/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2470838/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2494090/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2524307/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:2030320/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:305199/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:311842/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:574690/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:690651/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:708547/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:743537/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:815308/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:850157/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1609132/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1126354/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1174920/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1237953/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1290834/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1310062/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1324862/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1421516/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1606778/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1008537/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1609426/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1622988/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1649358/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1728385/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1775421/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:185656/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1905759/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:1918200/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTACt  >  1:2051983/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTAACGTTCCt  >  1:1507459/1‑64 (MQ=255) cGAATCACATCCTGGCTTAATCACTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCt  >  1:534011/1‑64 (MQ=255) |                                                                CGAATCACATCCTGGCTTAATCAGTAGCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCT  >  W3110S.gb/303872‑303935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑