Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4120376	4120408	33	31 [0]	[0] 22	hofQ	predicted fimbrial transporter

TCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACA  >  W3110S.gb/4120409‑4120472 |                                                                tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATc                        >  1:1101634/1‑42 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:935485/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:1066722/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:896853/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:809055/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:761889/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:612816/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:517604/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:382880/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:312410/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:2459060/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:2419771/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:2415380/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:2355076/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:2047705/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:1791252/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:159951/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:1496036/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:1396712/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:1278233/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACa  >  1:1184178/1‑64 (MQ=255) tCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGAATCTTGAGCTTTCcgc           >  1:515638/1‑55 (MQ=255) |                                                                TCGGTTTTAACATTGGGCGCATCAACGGACGCTTGCTGGATCTTGAGCTTTCCGCGCTCGAACA  >  W3110S.gb/4120409‑4120472

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑