Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4142940	4142965	26	27 [0]	[0] 33	nirC	nitrite transporter

TGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGC  >  W3110S.gb/4142966‑4143030 |                                                                 tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:59901/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:240896/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2417376/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2454580/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:25164/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2527763/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:32226/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:399454/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:516850/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2270817/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:732836/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:770348/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:773430/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:840173/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:86380/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:933380/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:984756/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1078708/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:226972/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2185027/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2172362/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2172062/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:2034978/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1722800/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1720558/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1625258/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1510582/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1459390/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1436173/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1364959/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1269348/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1263546/1‑65 (MQ=255) tGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGc  >  1:1095462/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TGCCGGTGCAGTGGTTTTAGCCAGCGCGACGGAGTGAACGATGCTGGTATCTACCGGCAGCAGGC  >  W3110S.gb/4142966‑4143030

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑