Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4170683	4170684	2	9 [0]	[0] 18	chiA	periplasmic endochitinase

TTCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGAA  >  W3110S.gb/4170685‑4170749 |                                                                 ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCTaa  <  1:840230/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:2277741/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:978334/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:908722/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:63850/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:359312/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:280092/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:2540859/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:2471123/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1156414/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:2098638/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:2032788/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1968218/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1885035/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1883310/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1741635/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1573022/65‑1 (MQ=255) ttCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGaa  <  1:1279194/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTCGATGGCAAAATTTATGAAAATGCCTGGTGGGTTTCTTCTACAAATTGCCCGGGAAAAGCGAA  >  W3110S.gb/4170685‑4170749

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑