Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4181481	4181534	54	21 [0]	[0] 23	gspE	general secretory pathway component, cryptic

CTTCCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAT  >  W3110S.gb/4181535‑4181599 |                                                                 cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:2040168/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:988585/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:925091/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:75456/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:708172/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:685040/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:556707/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:465092/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:339767/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:2521956/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:2497867/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:2484156/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1153702/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:2002802/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1989021/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1975988/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1688835/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:162809/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1557268/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1466392/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1444130/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1321506/65‑1 (MQ=255) cttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAt  <  1:1302736/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTTCCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGAGAT  >  W3110S.gb/4181535‑4181599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑