Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	312964	312971	8	7 [0]	[1] 34	ykgM/eaeH	predicted ribosomal protein/attaching and effacing protein, pathogenesis factor

TTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATC  >  W3110S.gb/312971‑313036  |                                                                 ttCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTAt   >  1:441166/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAAt                              >  1:296221/1‑37 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAAtt                      >  1:166495/1‑45 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCAtca                 >  1:264549/1‑48 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAg            >  1:2126664/1‑55 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTtg         >  1:2385332/1‑58 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:549408/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:293025/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:304696/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:387563/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:491804/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:892261/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:632774/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:639575/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:651936/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:694426/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:720628/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:771363/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:822553/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:268630/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:2498868/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:2404773/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:2401811/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:2212458/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:2019906/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:2017318/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:1746103/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:1725196/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:170489/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:1699998/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:1542497/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:1488832/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATc  >  1:1250120/1‑65 (MQ=255)  tCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTAAAGAACAAGTTGTGTTAt   >  1:1134480/1‑64 (MQ=255)  |                                                                 TTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATC  >  W3110S.gb/312971‑313036

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑